Câu chuyện của phim có thể kể Xuất thân từ vị thế cùng là giám đốc của hai công ty thiết kế nội thất đang cạnh tranh nhau quyết liệt, Khoa Đăng không ngờ có một ngày anh lại phải lòng Ánh Dương- cô gái có tính cách lạnh lùng, quyết đoán và yêu cô nhiều đến thế dù cho công ty của anh đang có nguy cơ mất trắng về tay cô. Trong khi đó, Ánh Dương cũng không ngờ rằng có ngày cô sẽ đồng hành cùng Khoa Đăng- người quá cảm tính trong công việc, hay cả nể với nhân viên, bạn bè dẫn đến nhiều tình huống tréo ngoe cho chính mình. Hai người ngỡ như không đội trời chung cuối cùng lại thường xuyên va chạm trong những vụ đấu thầu, thi công công trình và sống gần nhà nhau trong một khu chung cư.
Mối tình của Khoa Đăng, Ánh Dương vừa hy hữu, vừa kỳ lạ và cũng hoàn hảo đến mức khiến cho những người xung quanh phải ghen tỵ, thế nhưng, để đến được bến bờ hạnh phúc, họ đã có không biết bao nhiêu lần phải đối mặt với những khó khăn và thử thách, kể cả việc đối mặt với những địch thủ đáng gờm như Điền- anh chàng lúc nào cũng theo đuổi Ánh Dương quyết liệt hay một Hương Giang đầy thủ đoạn luôn tìm mọi cách để "giăng bẫy" Khoa Đăng.
Mối quan hệ cùng công việc của họ từ lúc yêu cho đến khi cưới còn liên tục bị phá rối bởi cặp anh em “trời đánh” Thành Danh, Hương Giang. Nhiều tình huống tưởng khiến họ xa nhau, nhiều khúc mắc tưởng chừng như bế tắc, thế nhưng với “Sếp ơi Anh yêu em”, bộ phim không chỉ kể một câu chuyện yêu đương đơn thuần lãng mạn như câu nói đặt tên, phim còn là những phút lắng đọng sâu sắc về tình cảm vợ chồng, về những trải nghiệm chân thực khi ta đối mặt với mối quan hệ tréo ngoe “Vợ - Sếp”.
Sếp ơi anh yêu em sẽ phát sóng hàng ngày trên TodayTV lúc 19h00 từ 01/10/2018 và YouTV lúc 21h30 từ 02/10/2018.